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中国林科院亚热带林业研究所东南景天全基因组测序获得了重要进展
【日期:2017-03-23】

    由中国林科院亚热带林业研究所林木遗传工程研究组获得的2016 “Explore You Most Interesting Genome” SMRT Grant Program东南景天全基因组测序获得了重要进展。中国林科院亚热带林业研究所林木遗传工程研究组经过一个月的努力,完成2种生态型东南景天基因组DNA提取纯化,获得了符合PacBio测序要求的基因组DNA,由PacBio美国总部构建50kb文库,完成了由PacBio等公司资助的基于sequel平台的免费测序任务,经过PacBio和德国Computomics公司拼接,日前PacBio中国林科院亚热带林业研究所林木遗传工程研究组卓仁英研究员提交了拼接数据。2种生态型东南景天基因组三代测序的完成,结合研究组前期完成illumina测序数据和拼接、转录组测序、iTRAQ和代谢组等相关研究结果,为研究组后续东南景天重金属耐受性和超积累性状形成与进化的研究奠定了良好的基础。

 

两种东南景天基因组组装情况

 

(来源:中国林科院亚热带林业研究所


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