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省农科院转基因安全评价团队开发出OAR-CRISPR新型核酸检测方法
【日期:2024-08-22】

 

近日,浙江省农业科学院转基因生物安全评价团队在Analytical Chemistry期刊(中科院1TOP期刊,IF=6.7)上发表了题为“A PAM-Free One-Step Asymmetric RPA and CRISPR/Cas12b Combined Assay (OAR-CRISPR) for Rapid and Ultrasensitive DNA Detection”的研究论文,首次建立了一种基于OAR-CRISPR的新型核酸检测方法。

以核酸为基础的检测方法主要采用两步程序,手动操作复杂化,且增加了污染的风险。如何将两种检测合并为一步程序,克服对crRNA选择的限制,解决固有不兼容难题。我们将不对称重组酶聚合酶扩增(RPA)技术与CRISPR/Cas系统结合,开发了一种OAR-CRISPR新型核酸检测方法。该方法将不对称PCR原理引入到RPA反应,使得CRISPR crRNA的应用不受原位间隔相邻基序(PAM)位点的限制,从而避免了RPA的预扩增,与传统的qPCR方法相比,OAR-CRISPR显示出相当的灵敏度,但检测时间仅为qPCR的四分之一,且可在八分钟内肉眼检测到每微升60个拷贝的靶标基因,为核酸检测开辟了新途径。

转基因生物安全团队杨蕾博士和硕士研究生陈冠玮为该论文共同第一作者,汪小福副研究员和徐俊锋研究员为共同通讯作者。研究工作得到国家2030-科技创新专项、浙江省“三农九方”项目、浙江省基金重点项目、浙江省科技创新领军人才项目等资助。

转基因生物安全团队长期从事转基因生物溯源检测技术、转基因生物环境安全评价与防控策略等,已研发转基因生物安全评价检测评价技术20余项,研制转基因生物快速检测产品12项,制定相关国家标准20余项,系统评价转基因抗虫、耐除草剂产品8个,为生物育种产业化提供了强有力技术支撑。

(来源:浙江省农业科学院)


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